分析仪器使用中难免会遇到一些问题，有的时候是因为操作不善导致的，有的时候则是因为系统本身就存在问题，使用中要及时发现问题，懂得排障，这样才能保证实验顺利进行。下面就介绍分析实验中可能会出现的问题，在使用不同设备的时候要做好各自的准备工作。
离子交换色谱是液相色谱中离子色谱的一种，它的主要原理是组分在固定相上发生离子交换，反应快的先被洗脱下来，慢的则被滞留。反应速度主要取决于离子带电荷的多少。在这里，赛默飞离子色谱可应对无论大样品还是小样品，可根据实验要求制定出行之有效的方案来。离子交换色谱中系统的压力会对；流动相的流速和压力产生影响， 一般是由系统进入空气导致的。如遇这种情况就得及时排除空气，具体做法是用超声波清洗含有异物的单向阀，以确保它能顺利密封。如果故障还是没有解除，那就要考虑是否其他密封圈出现了问题，及时更换易损部分有利于实验顺利进行。
电感耦合等离子体质谱仪中比较核心的部分要数等离子发生器，它将样品组分进行等离子化处理，这个过程是一些未带电荷的物质带上了电荷，以便于质谱分析。赛默飞科技将ICP-MS系统进行了生机和华，这样可以实现更智能化，得到更准确的实验数据。这类仪器使用中同样会出现一些问题，例如打火失败。等离子发生器中有打火系统，其中矩管、中心管等都是其关键结构，如果这里有积液或者杂物的时候是会产生一些问题。在仪器启动之前可以先对其进行干燥处理，检查有无杂物，以这样可以避免此类情况的发生。
